Cytoscape [Network Analysis]: Bakmak ile Görmek Arasındaki Fark

"Bakmakla görmek, aşık olmakla sevmek arasındaki fark nedir diye sormuşlar Mevlana’ya..

Cevaplamış: Senin baktığına herkes bakıyor; ama ya görebildiğini herkes görebiliyor mu? Herkes aşık olabiliyor; ama herkes senin gibi sevebiliyor mu?  Aralarındaki tek fark sensin… Seni özel kılan görebildiğini ve sevebildiğini bilmektir…"

III. Uluslararası Moleküler Biyoloji Kongresi: Bir Beyin Bir Başka Beyni Kurtarırken...

“Hiç bir saldırıdan korkma!

Dış dünyadan gelen her saldırı, gerçekten anlamak ve değişmek isteyenler için çok değerli bir armağandır. En acımasız olanı dahil her zarar veren saldırı, sadece, kendi kendine düşleyip eyleme geçirdiğin bir iyileşme süreci olarak meydana gelebilir.” 

Stefano E. D'Anna

Varoluş üzerine yazılmış en önemli felsefi kitaplardan “Tanrılar Okulu'nun” yazarı olan S. E. D'Anna' yı kaybettiğimiz şu günlerde onun felsefesini benimsemiş biri olarak hissettiklerimi anlatamam. Henüz kendisiyle tanışmamıştım oysa. Onun öğrencisi olarak yaşadığım şu hayatta onun felsefesini biraz çağrıştıran bir kongreden bahsedeceğim.

III. International Congress of the Molecular Biology Association of Turkey adıyla İYTE' de düzenlenen kongrede hissettiğim, öğrendiğim ve deneyimlediğim ne varsa paylaşmak istiyorum. Paylaşmak istiyorum ki bu farkındalık çoğalsın, akademisyenlerimiz bir ders çıkarsın, öğrencilerimiz ise olması gereken davranışın bu olması gerektiğini görsün ve kendi hocalarından bu davranışı beklesin.

Shiny [RStudio]: Web Uygulaması ile Hayatı Anlamayı Kolaylaştırma

                                    “İstatistik: Cehaletin matematiksel teorisi.”

Morris Kline

Matematik profesörü Kline istatistik hakkında bu sözü söylerken temelini neye dayandırdığını uzunca bir süre düşündükten sonra yazmaya karar verdim. Cehalet hakkında çokça söylenen söz varken sanırım en güzeli ve en ılımlısı bu şekilde kullanılmış olmalı.

“Bilmek” kavramının çok kıymetli olduğu günümüzde bir şeyleri anlamlandırmaya çalışmak çokça gereksinim duyduğumuz bir şey. Ahmet Raşit Hocamızın bu haftaki blog yazısında değindiği gibi kelimeler çoğu zaman ifadelenmesi herkes için aynı oranda olmayan bir şey fakat sembolize edilmiş veriler herkes tarafından aynı algılandığından dolayı görselleştirme kıymetlidir.

Görselleştirme [Visualization]: Meme Kanseri Analizi

       "Korku  ve şüphe, düşün kanseridir." 

                                                                            Dreamer

Yaşarken fark edemediğimiz en önemli şey; olumsuz duyguların bizleri yönettiği. Vücumuzda ortaya çıkan her türlü hastalığın temelinde psikoloji yatmakta. Bizim seçimlerimiz bizi "şimdi" de karşılar. Yaşadığımız her ne ise onu düşüncelerimizle var ettik, var etmeye de devam ediyoruz. Tabi var ettiklerimiz düşüncede veya duygularda kalmıyor, vücudumuzda deneylerle ortaya konulabilen değişiklikler ortaya çıkarıyor. Kaybetme korkusu, şüphe, gelecek kaygısı gibi duygular düşün kanseriyken, birden bu duyguların sonuçlarıyla meme, akciğer, mide kanseri gibi kanserlere yakalanıyoruz.

Machine Learning [Makine Öğrenmesi]: Yapay Zeka

 "Hiç çok gerçek olduğundan emin olduğun bir düş gördün mü Neo? Peki, bu düşten hiç uyanmasaydın, düşler dünyasıyla gerçek dünya arasındaki farkı nasıl anlayacaktın?"
MORPHEUS

Yapay zekaya hoş geldiniz! Ya da sınırlandırılmış zeka mı demeliyim. Sınırlandırılmış, kurgulanmış bir zeka sizce de yapay değil mi? Fakat hayatımızı kolaylaştırmak veya hazlarımızı gerçekleştirmek adına yapay zekaya ihtiyaç duyuyoruz. İnsanlığın zekasını ön plana çıkarmak için mi yoksa üşengeçliğini göz ardı etmek için mi buna ihtiyaç duyduğuna tam olarak karar veremesemde, belirli bir hissin bizi buna çektiğine eminim.

D3js [Data-Driven Documents]: Görüntülemek anlamanın yarısıdır!

“Fiziksel objelerin aslında kendilerinden gerçekliklerinin 

olmadığını öğretiyorum, bunların ancak zihnin ürünleri 

olduğunu söylüyorum, aslında hepsi bir hayaldir. 

Bunların duyularla algılandığı ve ayırt edildiği doğrudur

 fakat aslında diğer yandan hiçbirinin kendiliğinden kendi

 doğaları, gerçeklikleri yoktur. Onlar gerçekte görülmüyorlar 

ama zihin tarafından ‘tasarımlanıyorlar’. Bir bakıma 

kavranabiliyorlar ama bir bakıma da gerçekte kavranamıyorlar.”

Buddha

"Kavramak" algısı ne kadar da anlatılamaz birşey değil mi? Beynimizin çalışma prensibi tamamen inanmaya kurulu olduğu sürece bizler zannettiğimize inanmaya, zannettiğimizi gerçek kılmaya devam edeceğiz. Her şeyin bir enerji olduğu evrenimizde var olmayanları var ederken bile aslında sadece düşünce de var ettiğimizi göz ardı ederek ve var ettiğimizi sahiplenerek yaşamaya devam ediyoruz. Ben de bugün kendime ait hissettiğim, var ettiğim, Buddha'nın dediği gibi “tasarladığım” bir şey üzerinden gideceğim.

Bayes Teoremi: Sözlerin seni ele veriyor!

“Bilimin temellerinden teknolojinin limitlerine,

bizzat insan durumunun tanmına kadar bence 

hesaplamanın kaderi geleceğimizin fikrini tanımlamaktır.” 

Stephen Wolfram

TEDTalks videolarından S.Wofram'ın “Her şey Teorisini Hesaplamak” konuşmasından çok etkilendiğimi söylemeliyim. Oluşturduğu programlarla aklınıza gelebilecek her şeyi hesaplamayı amaçladığını, bunu da başardığını görebiliyoruz ve sonunda şöyle bir farkındalıkla vurucu etkisini yapıyor. Doğada görülen karmaşık sistemlerin oluşmasını bir kaç basit kural sağlayabilir! Elimizle oluşturduğumuz basit bir kaç basit kuralın farklı kombinasyonlarda bir araya gelmesiyle tahmin bile edemeyeceğimiz kompleks oluşumlar meydana gelebilmektedir. Bu bilinçle basit birkaç kuralın değişikliğiyle farklı evrenlerin keşfi veya oluşumu ne kadar da mümkün :).